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磺化Cy3-N-羥基琥珀酰亞胺酯（Sulfo-Cy3 NHS Ester）是一種水溶性紅色熒光染料活性酯，屬于三甲基甲烷類（cyanine）熒光探針。其分子結(jié)構(gòu)在Cy3核心骨架上引入磺酸基團(tuán)，使其具有良好的水溶性，減少了染料在水相環(huán)境中的聚集和自猝滅效應(yīng)。

這類染料的激發(fā)波長通常在 550 nm 左右，發(fā)射波長約為 570 nm，發(fā)射光亮麗，熒光量子產(chǎn)率較高，背景噪聲較低，特別適用于熒光成像、流式細(xì)胞術(shù)、熒光原位雜交（FISH）及蛋白標(biāo)記等生物分析領(lǐng)域。

NHS（N-羥基琥珀酰亞胺）酯活性基團(tuán)賦予該染料與生物大分子偶聯(lián)的便利性，尤其能高效地與蛋白質(zhì)、肽或其他含伯胺基團(tuán)的分子通過酰胺鍵形成穩(wěn)定的共價連接。這種偶聯(lián)化學(xué)通常在溫和的pH（7.2–8.5）條件下進(jìn)行，適合對生物活性分子敏感的實驗環(huán)境。

磺化Cy3 NHS酯的高度親水性使其在純水溶液、PBS緩沖液及多種生物體系中均易于溶解，簡化了染料的使用流程，并減少非特異性結(jié)合。

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